Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm3020E9Q3J7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm3020E9Q3J7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm3020E9Q3J7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3020E9Q3J7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms