Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx60E9PZQ1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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