Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3298E9PW80 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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