Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms