Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048679D3YXE9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms