Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms