Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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