Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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H2-M5A7VMS3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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H2-M5A7VMS3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M5A7VMS3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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