Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms