Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
AgrnA2ASQ1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms