Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms