Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Crlf3Q9Z2L7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Crlf3Q9Z2L7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms