Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms