Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn6Q9Z262 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms