Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nek4Q9Z1J2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms