Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skp2Q9Z0Z3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms