Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms