Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Stub1Q9WUD1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms