Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ptpn4Q9WU22 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ptpn4Q9WU22 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ptpn4Q9WU22 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn4Q9WU22 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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