Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp1Q9QY53 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms