Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Limd1Q9QXD8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Limd1Q9QXD8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Limd1Q9QXD8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Limd1Q9QXD8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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