Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms