Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms