Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Crlf1Q9JM58 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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