Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms