Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms