Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hmgn5Q9JL35 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hmgn5Q9JL35 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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