Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tuba8Q9JJZ2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tuba8Q9JJZ2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tuba8Q9JJZ2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tuba8Q9JJZ2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tuba8Q9JJZ2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Tuba8Q9JJZ2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Tuba8Q9JJZ2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Tuba8Q9JJZ2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tuba8Q9JJZ2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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