Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3bQ9ES34 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms