Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER97

Ngb, Neuroglobin, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgbQ9ER97 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NgbQ9ER97 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms