Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tm9sf1Q9DBU0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tm9sf1Q9DBU0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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