Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms