Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Alkbh4Q9D8F1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms