Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn23Q9D7D7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn23Q9D7D7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn23Q9D7D7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms