Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsraQ9D6Y7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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