Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al3Q9D4U4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms