Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1Q9D495 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms