Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trmt44Q9D2Q2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms