Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Zbed3Q9D0L1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Zbed3Q9D0L1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed3Q9D0L1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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