Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CYI0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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