Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms