Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Sgo1Q9CXH7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
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Sgo1Q9CXH7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Sgo1Q9CXH7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Sgo1Q9CXH7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Sgo1Q9CXH7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Sgo1Q9CXH7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Sgo1Q9CXH7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Sgo1Q9CXH7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Sgo1Q9CXH7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Sgo1Q9CXH7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Sgo1Q9CXH7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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