Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cnih4Q9CX13 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cnih4Q9CX13 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cnih4Q9CX13 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cnih4Q9CX13 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cnih4Q9CX13 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cnih4Q9CX13 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cnih4Q9CX13 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Cnih4Q9CX13 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Cnih4Q9CX13 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Cnih4Q9CX13 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Cnih4Q9CX13 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Cnih4Q9CX13 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih4Q9CX13 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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