Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms