Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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