Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms