Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pard3bQ9CSB4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms