Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms