Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms