Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rpa3Q9CQ71 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpa3Q9CQ71 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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